Il manoscritto si apre con una sezione intitolata Dialectica institutiones (suddivisa in capitoli), segue l’opera Dialectica disputata suddivisa in Questio, Propositio, articoli e corollari. Gli argomenti sono: De Percetione, De Idearum Veritate, Metaphisica ijusdem creata rei, De Idearum Relatione, De Iudicio, De veritate et falsitate, An intellectus possit physice assentiri [...], Sive sic ratiotinacio ecc. L’Albero di Porfirio, uno dei diagrammi inseriti tra le prime pagine del testo, riproduce la strutturazione del mondo – la gerarchia genera e species - evidenzia la concatenazione dei concetti conoscitivi fondamentali, e sottolinea la dipendenza di una dimensione dall’altra. E’ dedotto dalle Isagoge di Porfirio, discepolo di Plotino. La storia dell'Arbor Porphyriana, da Tommaso d'Aquino ai filosofi scolastici nei secoli XVII e XVIII, costituisce un’interessante pietra di paragone per lo sviluppo di fondamentali ipotesi filosofiche.